消えません。Xperia本体メモリに保存してあるすべてのユーザーデータに関しては、消すか消さないかお客様が選択可能です。
Xperia本体メモリに保存してあるすべてのユーザーデータおよび、ユーザー設定を工場出荷状態に戻す選択肢もあります。